こんにちは！人間発達科学部2年のハセベです！！

　質問の回答としては、「大丈夫です」と申しあげます。
　基本的にミールでお支払いできない場合、電子マネーから引き落とされるようです。またレジの表記として、商品をご購入される方がミールチャージを利用可能か表示されます。その為レジの方もそれ見てから、お支払い方法を尋ねていると思われます。