こんにちは！
質問ありがとうございます。工学部工学科応用化学コース1年のたっちーです。
応用化学コースの授業においては、Macでも対応はできると思います！私の友人で入学からMacを使っている方がいますが、授業に対応できないという声は聞かなかったので、少なくとも1年生の間は問題ないと思います。
工学部の端末室のパソコンはWindowsの可能性があります。Macの購入を検討されるのであれば、Windowsのパソコンの操作に慣れておくことも大切です。